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1883 - Don Antonio Costa fonda il Ginnasio G. Mezzofanti presso la Parrocchia di S. Martino Maggiore a Bologna. Da subito si distingue per il consistente numero di insegnanti laici, alcuni dei quali sono anche docenti universitari
1911 - Dopo alcuni anni nella sede di via S. Alò, la scuola passa in gestione ai Padri Filippini, si sposta in via Monari e prende il nome di Marcello Malpighi
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1919 - Accanto al Ginnasio prende avvio l’ Istituto Tecnico. Per un certo periodo, la sede torna ad essere in via S. Alò
1926 - Diviene preside Mons. Eutemio Grandi che, per 40 anni, segna profondamente la vita della scuola e della città con la fede ed il proprio carisma educativo
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1939 - Il Malpighi si sposta in Corte Galluzzi
1943 - Il Malpighi assume la struttura definitiva di Liceo Scientifico
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1975 - La scuola si trasferisce nell’attuale sede di via S. Isaia e pochi anni dopo apre il Liceo Linguistico
1988 - La Fondazione Ritiro S. Pellegrino diviene ente gestore del Malpighi. Alcuni docenti, sostenuti con forza dal presidente Mons. Benazzi e S.E. Card. Biffi, rilanciano la proposta educativa
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1991 - Nasce il Liceo Economico Europeo. La proposta didattica è frutto della stretta collaborazione tra la scuola ed esponenti del mondo universitario e imprenditoriale. Fin da subito vengono messe a disposizione alcune Borse di Studio. Il Cav. E. Montanelli, per primo, investe sull’idea che il Malpighi fornisca un servizio realmente pubblico, aperto a tutti, senza discriminazioni di reddito
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1993 - Nascono il Liceo Scientifico ad indirizzo “Ricerca” e il Liceo Linguistico ad indirizzo di “Comunicazione Europea”
1995 - Diviene preside Elena Ugolini
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1999 - Apre la Scuola Media con l’idea di puntare sulle materie “fondanti” come l’Italiano e la Matematica, di curare l’acquisizione di un’ottima padronanza dell’Inglese senza trascurare la parte di laboratorialità in Musica e Arte
2003 - Viene completamente ristrutturata la sede dei Licei di via S. Isaia, costruita una nuova palestra e nuovi laboratori
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2004 - Nasce il Progetto Bologna Rifà Scuola che intende riportare l’educazione al centro dell’attenzione
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2005 - Viene inaugurato il Polo Didattico di via Audinot con la nuova Scuola Media e il Centro Specialistico per l’Apprendimento. La realizzazione del Polo Didattico viene sostenuta dalla Fondazione CARISBO con l’impegno del prof. Roversi Monaco e dai fondi del progetto Bologna Rifà Scuola
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2007 - Nasce Martino Ti orienta, il progetto orientamento rivolto non solo agli studenti Malpighi ma a tutti i ragazzi di quinta superiore di Bologna e provincia
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2008 - La Fondazione Ducati e il Liceo Malpighi creano Fisica in Moto: il laboratorio didattico interattivo di Fisica dedicato agli studenti delle superiori di tutta Italia
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2008 - Con il sostegno di S.E. Cardinale Caffarra, il Ritiro San Pellegrino, con il presidente don G. Porcarelli, rileva le storiche Scuole Visitandine a Castel S. Pietro Terme e lì apre il Liceo Scientifico Scienze Applicate
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2016 - Le Scuole Malpighi crescono. La Fondazione Ritiro S. Pellegrino diviene ente gestore delle Scuole Elisabetta Renzi di Cento, una preziosa e vivace realtà educativa con una Scuola per l’Infanzia, una Scuola Primaria ed una Media
Il Liceo, prima scuola italiana, diviene sede accreditata per lo svolgimento del test S.A.T.
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2016 - Nello stesso anno viene inaugurato il Malpighi La.B: il laboratorio di informatica, robotica e automazione, design e progettazione 3D a disposizione dei ragazzi del Malpighi. Primo partner e sostenitore del Malpighi La.B è la famiglia Bonfiglioli
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2018 - Nasce la seconda scuola media di Bologna: il Campus di Villa Revedin, un modo nuovo di interpretare l’esperienza educativa. 2200 mq. dedicati alla scuola, 11 ettari di parco, orto didattico, laboratori di scienze, tecnologia e STEAM. Aule all'aperto e area sportiva
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2020 - Con il contributo di FAAC viene realizzato l’Obeya Lab che assieme al Malpighi La.B costituisce il polo laboratoriale dei Licei Malpighi
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2021 - Grazie a UnipolSai, nel parco di Villa Revedin vengono realizzate le aree per i diversi sport: pallone pressostatico, campo calcio a 5 e area multisport